Protein–RNA interactions for Protein: Q08AE8

SPIRE1, Protein spire homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1Q08AE8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.8 ms