Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SIK1P57059 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SIK1P57059 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SIK1P57059 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SIK1P57059 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SIK1P57059 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SIK1P57059 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SIK1P57059 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIK1P57059 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIK1P57059 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIK1P57059 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIK1P57059 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIK1P57059 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIK1P57059 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIK1P57059 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SIK1P57059 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SIK1P57059 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SIK1P57059 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SIK1P57059 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SIK1P57059 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SIK1P57059 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SIK1P57059 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SIK1P57059 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SIK1P57059 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SIK1P57059 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SIK1P57059 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SIK1P57059 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SIK1P57059 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SIK1P57059 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SIK1P57059 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SIK1P57059 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SIK1P57059 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SIK1P57059 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SIK1P57059 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SIK1P57059 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SIK1P57059 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIK1P57059 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIK1P57059 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIK1P57059 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIK1P57059 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIK1P57059 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIK1P57059 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIK1P57059 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIK1P57059 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIK1P57059 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SIK1P57059 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SIK1P57059 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SIK1P57059 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SIK1P57059 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SIK1P57059 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SIK1P57059 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SIK1P57059 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SIK1P57059 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SIK1P57059 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SIK1P57059 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SIK1P57059 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SIK1P57059 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SIK1P57059 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SIK1P57059 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SIK1P57059 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SIK1P57059 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SIK1P57059 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SIK1P57059 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIK1P57059 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIK1P57059 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIK1P57059 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIK1P57059 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIK1P57059 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIK1P57059 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIK1P57059 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIK1P57059 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIK1P57059 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIK1P57059 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIK1P57059 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SIK1P57059 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SIK1P57059 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SIK1P57059 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SIK1P57059 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SIK1P57059 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SIK1P57059 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIK1P57059 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIK1P57059 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIK1P57059 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIK1P57059 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIK1P57059 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIK1P57059 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIK1P57059 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIK1P57059 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIK1P57059 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIK1P57059 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SIK1P57059 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIK1P57059 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SIK1P57059 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIK1P57059 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIK1P57059 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIK1P57059 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIK1P57059 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIK1P57059 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIK1P57059 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIK1P57059 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.1 ms