Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EMP3P54852 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EMP3P54852 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EMP3P54852 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EMP3P54852 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EMP3P54852 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EMP3P54852 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EMP3P54852 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EMP3P54852 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EMP3P54852 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EMP3P54852 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EMP3P54852 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EMP3P54852 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EMP3P54852 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EMP3P54852 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EMP3P54852 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EMP3P54852 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EMP3P54852 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EMP3P54852 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EMP3P54852 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EMP3P54852 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EMP3P54852 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EMP3P54852 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EMP3P54852 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EMP3P54852 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EMP3P54852 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EMP3P54852 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EMP3P54852 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EMP3P54852 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EMP3P54852 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMP3P54852 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMP3P54852 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMP3P54852 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMP3P54852 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMP3P54852 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMP3P54852 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMP3P54852 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMP3P54852 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMP3P54852 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMP3P54852 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EMP3P54852 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMP3P54852 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMP3P54852 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMP3P54852 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMP3P54852 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMP3P54852 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMP3P54852 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMP3P54852 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMP3P54852 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EMP3P54852 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EMP3P54852 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EMP3P54852 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EMP3P54852 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EMP3P54852 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EMP3P54852 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EMP3P54852 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EMP3P54852 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EMP3P54852 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EMP3P54852 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EMP3P54852 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EMP3P54852 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EMP3P54852 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EMP3P54852 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EMP3P54852 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EMP3P54852 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EMP3P54852 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EMP3P54852 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EMP3P54852 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EMP3P54852 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EMP3P54852 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EMP3P54852 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EMP3P54852 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EMP3P54852 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EMP3P54852 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EMP3P54852 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EMP3P54852 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EMP3P54852 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EMP3P54852 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EMP3P54852 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EMP3P54852 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EMP3P54852 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EMP3P54852 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EMP3P54852 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EMP3P54852 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EMP3P54852 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EMP3P54852 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EMP3P54852 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EMP3P54852 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EMP3P54852 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EMP3P54852 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EMP3P54852 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EMP3P54852 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EMP3P54852 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EMP3P54852 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EMP3P54852 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EMP3P54852 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EMP3P54852 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EMP3P54852 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EMP3P54852 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EMP3P54852 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.7 ms