Protein–RNA interactions for Protein: P49736

MCM2, DNA replication licensing factor MCM2, humanhuman

Predictions only

Length 904 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM2P49736 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
MCM2P49736 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
MCM2P49736 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCM2P49736 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCM2P49736 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCM2P49736 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCM2P49736 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCM2P49736 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCM2P49736 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCM2P49736 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCM2P49736 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCM2P49736 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCM2P49736 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCM2P49736 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCM2P49736 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCM2P49736 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCM2P49736 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCM2P49736 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCM2P49736 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCM2P49736 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCM2P49736 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCM2P49736 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCM2P49736 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCM2P49736 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCM2P49736 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCM2P49736 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCM2P49736 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCM2P49736 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCM2P49736 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCM2P49736 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCM2P49736 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCM2P49736 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCM2P49736 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCM2P49736 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCM2P49736 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCM2P49736 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCM2P49736 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCM2P49736 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCM2P49736 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
MCM2P49736 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCM2P49736 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
MCM2P49736 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCM2P49736 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCM2P49736 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCM2P49736 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCM2P49736 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCM2P49736 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCM2P49736 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCM2P49736 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCM2P49736 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCM2P49736 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MCM2P49736 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCM2P49736 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MCM2P49736 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCM2P49736 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCM2P49736 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCM2P49736 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCM2P49736 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCM2P49736 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCM2P49736 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCM2P49736 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MCM2P49736 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
MCM2P49736 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCM2P49736 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCM2P49736 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCM2P49736 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCM2P49736 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCM2P49736 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCM2P49736 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCM2P49736 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCM2P49736 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCM2P49736 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCM2P49736 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCM2P49736 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCM2P49736 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCM2P49736 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCM2P49736 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCM2P49736 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCM2P49736 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCM2P49736 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCM2P49736 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCM2P49736 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCM2P49736 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCM2P49736 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCM2P49736 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCM2P49736 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCM2P49736 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCM2P49736 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCM2P49736 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCM2P49736 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCM2P49736 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCM2P49736 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCM2P49736 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCM2P49736 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCM2P49736 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCM2P49736 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCM2P49736 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
MCM2P49736 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCM2P49736 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCM2P49736 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 416.7 ms