Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DMDP11532 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DMDP11532 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DMDP11532 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DMDP11532 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DMDP11532 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DMDP11532 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DMDP11532 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DMDP11532 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DMDP11532 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DMDP11532 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DMDP11532 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DMDP11532 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DMDP11532 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DMDP11532 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DMDP11532 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DMDP11532 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DMDP11532 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DMDP11532 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DMDP11532 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DMDP11532 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DMDP11532 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DMDP11532 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DMDP11532 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DMDP11532 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
DMDP11532 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
DMDP11532 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DMDP11532 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DMDP11532 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DMDP11532 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DMDP11532 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DMDP11532 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DMDP11532 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DMDP11532 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DMDP11532 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DMDP11532 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DMDP11532 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DMDP11532 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DMDP11532 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DMDP11532 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DMDP11532 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DMDP11532 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DMDP11532 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DMDP11532 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DMDP11532 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DMDP11532 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DMDP11532 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DMDP11532 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DMDP11532 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DMDP11532 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DMDP11532 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DMDP11532 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DMDP11532 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DMDP11532 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DMDP11532 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DMDP11532 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DMDP11532 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DMDP11532 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DMDP11532 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DMDP11532 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DMDP11532 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DMDP11532 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DMDP11532 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DMDP11532 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DMDP11532 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DMDP11532 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DMDP11532 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DMDP11532 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DMDP11532 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DMDP11532 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DMDP11532 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DMDP11532 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DMDP11532 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DMDP11532 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DMDP11532 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DMDP11532 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DMDP11532 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DMDP11532 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DMDP11532 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DMDP11532 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DMDP11532 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DMDP11532 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DMDP11532 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DMDP11532 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DMDP11532 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DMDP11532 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DMDP11532 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DMDP11532 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DMDP11532 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DMDP11532 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DMDP11532 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DMDP11532 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DMDP11532 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DMDP11532 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DMDP11532 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DMDP11532 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
DMDP11532 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DMDP11532 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DMDP11532 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DMDP11532 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms