Protein–RNA interactions for Protein: O60658

PDE8A, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8A, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8AO60658 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE8AO60658 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms