Protein–RNA interactions for Protein: A6NDS4

TBC1D3B, TBC1 domain family member 3B, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D3BA6NDS4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBC1D3BA6NDS4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBC1D3BA6NDS4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBC1D3BA6NDS4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBC1D3BA6NDS4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBC1D3BA6NDS4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TBC1D3BA6NDS4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBC1D3BA6NDS4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBC1D3BA6NDS4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TBC1D3BA6NDS4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TBC1D3BA6NDS4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TBC1D3BA6NDS4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TBC1D3BA6NDS4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TBC1D3BA6NDS4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TBC1D3BA6NDS4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TBC1D3BA6NDS4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TBC1D3BA6NDS4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBC1D3BA6NDS4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBC1D3BA6NDS4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms