Protein–RNA interactions for Protein: Q96I24

FUBP3, Far upstream element-binding protein 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUBP3Q96I24 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.544e-9■■■■■ 41.1
FUBP3Q96I24 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.556e-8■■■■■ 41
FUBP3Q96I24 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.972e-10■■■■■ 41
FUBP3Q96I24 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.512e-10■■■■■ 41
FUBP3Q96I24 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.412e-10■■■■■ 41
FUBP3Q96I24 CFLAR-211ENST00000439154 1310 ntTSL 1 (best)17.64■□□□□ 0.412e-10■■■■■ 41
FUBP3Q96I24 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.322e-10■■■■■ 41
FUBP3Q96I24 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.262e-10■■■■■ 41
FUBP3Q96I24 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.152e-10■■■■■ 41
FUBP3Q96I24 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.052e-10■■■■■ 41
FUBP3Q96I24 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.042e-10■■■■■ 41
FUBP3Q96I24 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.392e-10■■■■■ 41
FUBP3Q96I24 CFLAR-222ENST00000474842 1091 ntTSL 1 (best)11.58□□□□□ -0.562e-10■■■■■ 41
FUBP3Q96I24 CFLAR-202ENST00000340870 963 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.62e-10■■■■■ 41
FUBP3Q96I24 CFLAR-215ENST00000457277 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.782e-10■■■■■ 41
FUBP3Q96I24 PTTG1-201ENST00000352433 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.022e-10■■■■■ 41
FUBP3Q96I24 PTTG1-204ENST00000519287 670 ntTSL 58.02□□□□□ -1.132e-10■■■■■ 41
FUBP3Q96I24 CFLAR-223ENST00000479953 1230 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.22e-10■■■■■ 41
FUBP3Q96I24 CFLAR-212ENST00000440180 1198 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.222e-10■■■■■ 41
FUBP3Q96I24 CFLAR-219ENST00000462763 588 ntTSL 25.05□□□□□ -1.62e-10■■■■■ 41
FUBP3Q96I24 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.559e-7■■■■■ 41
FUBP3Q96I24 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.641e-8■■■■■ 41
FUBP3Q96I24 AGAP3-203ENST00000461065 1707 ntTSL 1 (best)16.38■□□□□ 0.211e-8■■■■■ 41
FUBP3Q96I24 AGAP3-226ENST00000622464 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.291e-8■■■■■ 41
FUBP3Q96I24 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.391e-8■■■■■ 41
FUBP3Q96I24 AGAP3-212ENST00000473633 3751 ntTSL 1 (best)9.23□□□□□ -0.931e-8■■■■■ 41
FUBP3Q96I24 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.266e-18■■■■■ 41
FUBP3Q96I24 AC010997.3-201ENST00000418818 502 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.296e-18■■■■■ 41
FUBP3Q96I24 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.381e-6■■■■■ 40.9
FUBP3Q96I24 AP2A2-205ENST00000525796 551 ntTSL 521.44■■□□□ 1.024e-7■■■■■ 40.7
FUBP3Q96I24 AP2A2-218ENST00000529858 550 ntTSL 420.82■□□□□ 0.924e-7■■■■■ 40.7
FUBP3Q96I24 AP2A2-212ENST00000528195 562 ntTSL 319.4■□□□□ 0.74e-7■■■■■ 40.7
FUBP3Q96I24 AP2A2-210ENST00000527024 527 ntTSL 418.37■□□□□ 0.534e-7■■■■■ 40.7
FUBP3Q96I24 AP2A2-221ENST00000531548 554 ntTSL 418.37■□□□□ 0.534e-7■■■■■ 40.7
FUBP3Q96I24 AP2A2-223ENST00000534485 556 ntTSL 417.85■□□□□ 0.454e-7■■■■■ 40.7
FUBP3Q96I24 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.44e-7■■■■■ 40.7
FUBP3Q96I24 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.214e-7■■■■■ 40.7
FUBP3Q96I24 AP2A2-213ENST00000528815 3072 ntTSL 213.72□□□□□ -0.214e-7■■■■■ 40.7
FUBP3Q96I24 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.234e-7■■■■■ 40.7
FUBP3Q96I24 AP2A2-203ENST00000524559 935 ntTSL 511.48□□□□□ -0.574e-7■■■■■ 40.7
FUBP3Q96I24 AP2A2-217ENST00000529818 549 ntTSL 410.94□□□□□ -0.664e-7■■■■■ 40.7
FUBP3Q96I24 AP2A2-219ENST00000530801 557 ntTSL 48.95□□□□□ -0.984e-7■■■■■ 40.7
FUBP3Q96I24 AP2A2-209ENST00000526753 464 ntTSL 44.26□□□□□ -1.734e-7■■■■■ 40.7
FUBP3Q96I24 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.613e-7■■■■■ 40.6
FUBP3Q96I24 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.033e-7■■■■■ 40.6
FUBP3Q96I24 ARID4B-211ENST00000474953 3463 ntTSL 212.26□□□□□ -0.453e-7■■■■■ 40.6
FUBP3Q96I24 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.231e-6■■■■■ 40.5
FUBP3Q96I24 H3F3B-203ENST00000586518 1701 nt30.92■■■□□ 2.549e-76■■■■■ 40.3
FUBP3Q96I24 H3F3B-209ENST00000589949 842 ntTSL 219.28■□□□□ 0.689e-76■■■■■ 40.3
FUBP3Q96I24 H3F3B-213ENST00000593254 894 ntTSL 514.13□□□□□ -0.159e-76■■■■■ 40.3
FUBP3Q96I24 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.339e-76■■■■■ 40.3
FUBP3Q96I24 H3F3B-212ENST00000592643 795 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.399e-76■■■■■ 40.3
FUBP3Q96I24 H3F3B-210ENST00000591890 783 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.569e-76■■■■■ 40.3
FUBP3Q96I24 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.653e-8■■■■■ 40.3
FUBP3Q96I24 PPFIA1-222ENST00000532504 5159 ntTSL 1 (best)16.02■□□□□ 0.163e-8■■■■■ 40.3
FUBP3Q96I24 PPFIA1-219ENST00000531657 3036 ntTSL 29.5□□□□□ -0.893e-8■■■■■ 40.3
FUBP3Q96I24 PPFIA1-206ENST00000526262 4537 ntTSL 1 (best)9.05□□□□□ -0.963e-8■■■■■ 40.3
FUBP3Q96I24 PPFIA1-215ENST00000530548 3774 ntTSL 27.86□□□□□ -1.153e-8■■■■■ 40.3
FUBP3Q96I24 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.563e-9■■■■■ 40
FUBP3Q96I24 XRN1-214ENST00000498077 5600 ntTSL 51.27□□□□□ -2.213e-9■■■■■ 40
FUBP3Q96I24 TCEA3-203ENST00000450454 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.439e-9■■■■■ 39.8
FUBP3Q96I24 IBTK-208ENST00000508381 2520 ntTSL 27.35□□□□□ -1.234e-7■■■■■ 39.6
FUBP3Q96I24 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.354e-7■■■■■ 39.6
FUBP3Q96I24 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.374e-7■■■■■ 39.6
FUBP3Q96I24 IBTK-203ENST00000445419 3663 ntTSL 24.25□□□□□ -1.734e-7■■■■■ 39.6
FUBP3Q96I24 IBTK-207ENST00000505222 5547 ntTSL 1 (best)2.91□□□□□ -1.944e-7■■■■■ 39.6
FUBP3Q96I24 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 05e-10■■■■■ 39.5
FUBP3Q96I24 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.365e-10■■■■■ 39.5
FUBP3Q96I24 CHN2-202ENST00000409041 2375 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.685e-10■■■■■ 39.5
FUBP3Q96I24 SDC2-207ENST00000522911 677 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.794e-28■■■■■ 39.5
FUBP3Q96I24 CHN2-211ENST00000424025 2279 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.975e-10■■■■■ 39.5
FUBP3Q96I24 CHN2-208ENST00000412711 2991 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.185e-10■■■■■ 39.5
FUBP3Q96I24 DCDC2-201ENST00000378450 3684 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.295e-10■■■■■ 39.5
FUBP3Q96I24 PPM1A-208ENST00000532036 1561 ntTSL 56.32□□□□□ -1.45e-10■■■■■ 39.5
FUBP3Q96I24 NAV2-201ENST00000349880 10960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.721e-7■■■■■ 39.4
FUBP3Q96I24 NAV2-208ENST00000527559 11171 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.781e-7■■■■■ 39.4
FUBP3Q96I24 NAV2-216ENST00000540292 11003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.191e-7■■■■■ 39.4
FUBP3Q96I24 NAV2-203ENST00000396085 11000 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.231e-7■■■■■ 39.4
FUBP3Q96I24 NAV2-202ENST00000360655 10667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.251e-7■■■■■ 39.4
FUBP3Q96I24 SLC31A1-201ENST00000374212 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.054e-15■■■■■ 39.2
FUBP3Q96I24 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.22e-8■■■■■ 39
FUBP3Q96I24 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.112e-8■■■■■ 38.9
FUBP3Q96I24 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.182e-8■■■■■ 38.9
FUBP3Q96I24 LRRFIP1-212ENST00000483443 1069 ntTSL 313.81□□□□□ -0.22e-8■■■■■ 38.9
FUBP3Q96I24 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.442e-7■■■■■ 38.6
FUBP3Q96I24 PRDM16-204ENST00000463591 384 ntTSL 521.87■■□□□ 1.094e-8■■■■■ 38.6
FUBP3Q96I24 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.464e-8■■■■■ 38.6
FUBP3Q96I24 ZSWIM5-202ENST00000464588 390 ntTSL 316.36■□□□□ 0.214e-8■■■■■ 38.6
FUBP3Q96I24 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.014e-8■■■■■ 38.6
FUBP3Q96I24 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.144e-8■■■■■ 38.6
FUBP3Q96I24 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.164e-8■■■■■ 38.6
FUBP3Q96I24 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.184e-8■■■■■ 38.6
FUBP3Q96I24 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.294e-8■■■■■ 38.6
FUBP3Q96I24 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.334e-8■■■■■ 38.6
FUBP3Q96I24 GATAD2B-211ENST00000637918 1027 ntTSL 512.76□□□□□ -0.374e-8■■■■■ 38.6
FUBP3Q96I24 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.374e-8■■■■■ 38.6
FUBP3Q96I24 PRDM16-207ENST00000512462 3723 ntTSL 1 (best)11.83□□□□□ -0.524e-8■■■■■ 38.6
FUBP3Q96I24 GATAD2B-201ENST00000368655 7478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.534e-8■■■■■ 38.6
FUBP3Q96I24 UBAP2L-207ENST00000428931 3988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.694e-8■■■■■ 38.6
FUBP3Q96I24 GPATCH2-201ENST00000366934 3218 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.714e-8■■■■■ 38.6
Retrieved 100 of 4,568 protein–RNA pairs in 34.1 ms