RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463591.1

PRDM16-204, Transcript of PR/SET domain 16, humanhuman

TSL 5

Gene PRDM16, Length 384 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM16-204ENST00000463591 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.33■■■■■ 5.65
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PRDM16-204ENST00000463591 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.62■■■■■ 4.41
PRDM16-204ENST00000463591 NACADO15069 1562 aa42.45■■■■■ 4.39
PRDM16-204ENST00000463591 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.33■■■■■ 4.37
PRDM16-204ENST00000463591 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.06■■■■■ 4.32
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PRDM16-204ENST00000463591 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.52■■■■■ 4.24
PRDM16-204ENST00000463591 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.39■■■■■ 4.22
PRDM16-204ENST00000463591 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.29■■■■■ 4.2
PRDM16-204ENST00000463591 SCRIBQ14160 1630 aa40.92■■■■■ 4.14
PRDM16-204ENST00000463591 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.91■■■■■ 4.14
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PRDM16-204ENST00000463591 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.08■■■■■ 4.01
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PRDM16-204ENST00000463591 SMARCA2P51531 1590 aa39.04■■■■□ 3.84
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PRDM16-204ENST00000463591 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.75■■■■□ 3.79
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PRDM16-204ENST00000463591 CUX2O14529 1486 aa38.27■■■■□ 3.72
PRDM16-204ENST00000463591 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.23■■■■□ 3.71
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PRDM16-204ENST00000463591 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.82■■■■□ 3.65
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PRDM16-204ENST00000463591 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.62■■■■□ 3.61
PRDM16-204ENST00000463591 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.56■■■■□ 3.6
PRDM16-204ENST00000463591 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.56■■■■□ 3.6
PRDM16-204ENST00000463591 WDR62O43379 1518 aa37.49■■■■□ 3.59
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PRDM16-204ENST00000463591 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.19■■■■□ 3.54
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PRDM16-204ENST00000463591 TOPBP1Q92547 1522 aa36.88■■■■□ 3.49
PRDM16-204ENST00000463591 IFT140Q96RY7 1462 aa36.82■■■■□ 3.49
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PRDM16-204ENST00000463591 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.78■■■■□ 3.48
PRDM16-204ENST00000463591 OSCARQ8IYS5 282 aa36.66■■■■□ 3.46
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PRDM16-204ENST00000463591 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.4■■■■□ 3.42
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PRDM16-204ENST00000463591 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.37■■■■□ 3.41
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PRDM16-204ENST00000463591 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.27■■■■□ 3.4
PRDM16-204ENST00000463591 WDR97A6NE52 1622 aa36.24■■■■□ 3.39
PRDM16-204ENST00000463591 TRIM41Q8WV44 630 aa36.23■■■■□ 3.39
PRDM16-204ENST00000463591 FBLN2P98095 1184 aa36.12■■■■□ 3.37
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PRDM16-204ENST00000463591 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.01■■■■□ 3.36
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PRDM16-204ENST00000463591 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.98■■■■□ 3.35
PRDM16-204ENST00000463591 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.98■■■■□ 3.35
PRDM16-204ENST00000463591 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.98■■■■□ 3.35
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PRDM16-204ENST00000463591 ARHGEF11O15085 1522 aa35.94■■■■□ 3.34
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PRDM16-204ENST00000463591 KIF27Q86VH2 1401 aa35.31■■■■□ 3.24
PRDM16-204ENST00000463591 IGF1RP08069 1367 aa35.25■■■■□ 3.23
PRDM16-204ENST00000463591 SHROOM2Q13796 1616 aa35.19■■■■□ 3.22
PRDM16-204ENST00000463591 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.18■■■■□ 3.22
PRDM16-204ENST00000463591 JPH4Q96JJ6 628 aa35.15■■■■□ 3.22
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PRDM16-204ENST00000463591 CUL7Q14999 1698 aa35.11■■■■□ 3.21
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