Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 AL365205.1-202ENST00000487182 3043 ntTSL 213.2□□□□□ -0.34e-14■■■■■ 45.2
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PRPF4O43172 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.351e-13■■■■■ 44.8
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PRPF4O43172 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.813e-9■■■■■ 44.5
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PRPF4O43172 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.225e-7■■■■■ 44.5
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PRPF4O43172 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.11e-6■■■■■ 42.3
PRPF4O43172 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.151e-6■■■■■ 42.3
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PRPF4O43172 RNASET2-208ENST00000496851 881 ntTSL 510.01□□□□□ -0.811e-12■■■■■ 41.9
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PRPF4O43172 ZFYVE9-204ENST00000371591 4874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.052e-12■■■■■ 41.6
PRPF4O43172 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.392e-12■■■■■ 41.6
PRPF4O43172 ARFRP1-204ENST00000609537 593 ntTSL 313.37□□□□□ -0.271e-12■■■■■ 41.6
PRPF4O43172 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.533e-12■■■■■ 41.5
PRPF4O43172 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.53e-12■■■■■ 41.5
PRPF4O43172 YKT6-202ENST00000421621 2463 ntTSL 1 (best)16.77■□□□□ 0.283e-12■■■■■ 41.5
PRPF4O43172 VGLL4-206ENST00000418000 792 ntTSL 323.77■■□□□ 1.42e-8■■■■■ 41.4
PRPF4O43172 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.352e-8■■■■■ 41.4
PRPF4O43172 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.172e-8■■■■■ 41.4
PRPF4O43172 VGLL4-215ENST00000458499 766 ntTSL 313.28□□□□□ -0.282e-8■■■■■ 41.4
PRPF4O43172 VGLL4-201ENST00000273038 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.52e-8■■■■■ 41.4
PRPF4O43172 VGLL4-213ENST00000445411 726 ntTSL 58.98□□□□□ -0.972e-8■■■■■ 41.4
PRPF4O43172 ZZZ3-203ENST00000414381 561 ntTSL 419.54■□□□□ 0.725e-9■■■■■ 41.4
PRPF4O43172 ZZZ3-206ENST00000463166 587 ntTSL 218.58■□□□□ 0.565e-9■■■■■ 41.4
PRPF4O43172 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.535e-9■■■■■ 41.4
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PRPF4O43172 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.032e-10■■■■■ 41.4
PRPF4O43172 TGIF2-204ENST00000558028 638 ntTSL 214.12□□□□□ -0.152e-10■■■■■ 41.4
PRPF4O43172 TGIF2-208ENST00000611732 3344 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.772e-10■■■■■ 41.4
PRPF4O43172 NSMF-207ENST00000371482 2888 ntTSL 1 (best)17.05■□□□□ 0.321e-6■■■■■ 41.4
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PRPF4O43172 NSMF-209ENST00000482448 551 ntTSL 310.39□□□□□ -0.751e-6■■■■■ 41.4
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