RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495312.1

TMEM214-213, Transcript of transmembrane protein 214, humanhuman

TSL 2

Gene TMEM214, Length 804 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM214-213ENST00000495312 NISCHQ9Y2I1 1504 aa68.58■■■■■ 8.57
TMEM214-213ENST00000495312 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa61.25■■■■■ 7.4
TMEM214-213ENST00000495312 ABCC9O60706 1549 aa60.72■■■■■ 7.31
TMEM214-213ENST00000495312 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa58.01■■■■■ 6.88
TMEM214-213ENST00000495312 NACADO15069 1562 aa57.78■■■■■ 6.84
TMEM214-213ENST00000495312 DCAF8L2P0C7V8 631 aa57.43■■■■■ 6.78
TMEM214-213ENST00000495312 MYO15BQ96JP2 1530 aa57.25■■■■■ 6.75
TMEM214-213ENST00000495312 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP57■■■■■ 6.72
TMEM214-213ENST00000495312 UNC13AQ9UPW8 1703 aa56.72■■■■■ 6.67
TMEM214-213ENST00000495312 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa56.71■■■■■ 6.67
TMEM214-213ENST00000495312 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP56.61■■■■■ 6.65
TMEM214-213ENST00000495312 DNAJC5BQ9UF47 199 aa56.57■■■■■ 6.65
TMEM214-213ENST00000495312 BICRAQ9NZM4 1560 aa56.43■■■■■ 6.62
TMEM214-213ENST00000495312 SCRIBQ14160 1630 aa55.85■■■■■ 6.53
TMEM214-213ENST00000495312 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa55.68■■■■■ 6.5
TMEM214-213ENST00000495312 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP54.93■■■■■ 6.38
TMEM214-213ENST00000495312 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa54.89■■■■■ 6.38
TMEM214-213ENST00000495312 CECR2Q9BXF3 1484 aa54.65■■■■■ 6.34
TMEM214-213ENST00000495312 NCAPD3P42695 1498 aa53.39■■■■■ 6.14
TMEM214-213ENST00000495312 SMARCA4P51532 1647 aa53.36■■■■■ 6.13
TMEM214-213ENST00000495312 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa53.31■■■■■ 6.12
TMEM214-213ENST00000495312 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP53.15■■■■■ 6.1
TMEM214-213ENST00000495312 SMARCA2P51531 1590 aa53.12■■■■■ 6.09
TMEM214-213ENST00000495312 HMGXB3Q12766 1538 aa53.03■■■■■ 6.08
TMEM214-213ENST00000495312 PEG3Q9GZU2 1588 aa52.9■■■■■ 6.06
TMEM214-213ENST00000495312 MROH2BQ7Z745 1585 aa52.87■■■■■ 6.05
TMEM214-213ENST00000495312 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP52.75■■■■■ 6.03
TMEM214-213ENST00000495312 NESP48681 1621 aa52.37■■■■■ 5.97
TMEM214-213ENST00000495312 ERCC6Q03468 1493 aa52.31■■■■■ 5.96
TMEM214-213ENST00000495312 WIZO95785 1651 aa52.22■■■■■ 5.95
TMEM214-213ENST00000495312 CUX2O14529 1486 aa52.11■■■■■ 5.93
TMEM214-213ENST00000495312 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa52.03■■■■■ 5.92
TMEM214-213ENST00000495312 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP51.98■■■■■ 5.91
TMEM214-213ENST00000495312 CADPSQ9ULU8 1353 aa51.76■■■■■ 5.88
TMEM214-213ENST00000495312 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP51.74■■■■■ 5.87
TMEM214-213ENST00000495312 PDS5BQ9NTI5 1447 aa51.69■■■■■ 5.87
TMEM214-213ENST00000495312 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa51.65■■■■■ 5.86
TMEM214-213ENST00000495312 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP51.62■■■■■ 5.85
TMEM214-213ENST00000495312 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa51.45■■■■■ 5.83
TMEM214-213ENST00000495312 CFTRP13569 1480 aa51.33■■■■■ 5.81
TMEM214-213ENST00000495312 MRC2Q9UBG0 1479 aa51.26■■■■■ 5.8
TMEM214-213ENST00000495312 WDR62O43379 1518 aa51.16■■■■■ 5.78
TMEM214-213ENST00000495312 FANCD2Q9BXW9 1451 aa51.16■■■■■ 5.78
TMEM214-213ENST00000495312 CEP164Q9UPV0 1460 aa51.14■■■■■ 5.78
TMEM214-213ENST00000495312 CCDC88BA6NC98 1476 aa51.03■■■■■ 5.76
TMEM214-213ENST00000495312 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP50.77■■■■■ 5.72
TMEM214-213ENST00000495312 PRDM2Q13029 1718 aa50.74■■■■■ 5.71
TMEM214-213ENST00000495312 TOPBP1Q92547 1522 aa50.27■■■■■ 5.64
TMEM214-213ENST00000495312 ABCC8Q09428 1581 aa50.13■■■■■ 5.61
TMEM214-213ENST00000495312 DNMBPQ6XZF7 1577 aa50.13■■■■■ 5.61
TMEM214-213ENST00000495312 IFT140Q96RY7 1462 aa50.12■■■■■ 5.61
TMEM214-213ENST00000495312 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP50.05■■■■■ 5.6
TMEM214-213ENST00000495312 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.93■■■■■ 5.58
TMEM214-213ENST00000495312 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP49.82■■■■■ 5.57
TMEM214-213ENST00000495312 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP49.82■■■■■ 5.57
TMEM214-213ENST00000495312 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP49.75■■■■■ 5.56
TMEM214-213ENST00000495312 OSCARQ8IYS5 282 aa49.74■■■■■ 5.55
TMEM214-213ENST00000495312 CUX1P39880 1505 aa49.65■■■■■ 5.54
TMEM214-213ENST00000495312 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP49.62■■■■■ 5.532e-8■■■■□ 24.7
TMEM214-213ENST00000495312 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa49.61■■■■■ 5.53
TMEM214-213ENST00000495312 FGD5Q6ZNL6 1462 aa49.56■■■■■ 5.52
TMEM214-213ENST00000495312 SOGA1O94964 1423 aa49.53■■■■■ 5.52
TMEM214-213ENST00000495312 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP49.39■■■■■ 5.5
TMEM214-213ENST00000495312 TRIM41Q8WV44 630 aa49.31■■■■■ 5.48
TMEM214-213ENST00000495312 WDR97A6NE52 1622 aa49.29■■■■■ 5.48
TMEM214-213ENST00000495312 CHD1O14646 1710 aa49.23■■■■■ 5.47
TMEM214-213ENST00000495312 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa49.12■■■■■ 5.45
TMEM214-213ENST00000495312 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa49.12■■■■■ 5.45
TMEM214-213ENST00000495312 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa49.12■■■■■ 5.45
TMEM214-213ENST00000495312 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa49.12■■■■■ 5.45
TMEM214-213ENST00000495312 GRIN2BQ13224 1484 aa49.06■■■■■ 5.44
TMEM214-213ENST00000495312 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa49.05■■■■■ 5.44
TMEM214-213ENST00000495312 ARHGEF11O15085 1522 aa49.04■■■■■ 5.44
TMEM214-213ENST00000495312 FBLN2P98095 1184 aa49.03■■■■■ 5.44
TMEM214-213ENST00000495312 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP49■■■■■ 5.44
TMEM214-213ENST00000495312 TOP2BQ02880 1626 aa48.96■■■■■ 5.43
TMEM214-213ENST00000495312 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP48.96■■■■■ 5.43
TMEM214-213ENST00000495312 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa48.96■■■■■ 5.43
TMEM214-213ENST00000495312 SYNJ1O43426 1573 aa48.95■■■■■ 5.43
TMEM214-213ENST00000495312 GAPVD1Q14C86 1478 aa48.95■■■■■ 5.43
TMEM214-213ENST00000495312 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa48.94■■■■■ 5.42
TMEM214-213ENST00000495312 PBRM1Q86U86 1689 aa48.87■■■■■ 5.41
TMEM214-213ENST00000495312 SYNJ2O15056 1496 aa48.85■■■■■ 5.41
TMEM214-213ENST00000495312 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP48.8■■■■■ 5.4
TMEM214-213ENST00000495312 CLASP1Q7Z460 1538 aa48.78■■■■■ 5.4
TMEM214-213ENST00000495312 ARAP1Q96P48 1450 aa48.63■■■■■ 5.38
TMEM214-213ENST00000495312 CYB5RLQ6IPT4 315 aa48.55■■■■■ 5.36
TMEM214-213ENST00000495312 ADAMTS12P58397 1594 aa48.51■■■■■ 5.36
TMEM214-213ENST00000495312 GRIN2AQ12879 1464 aa48.44■■■■■ 5.35
TMEM214-213ENST00000495312 ERICH3Q5RHP9 1530 aa48.42■■■■■ 5.34
TMEM214-213ENST00000495312 FHAD1B1AJZ9 1412 aa48.36■■■■■ 5.33
TMEM214-213ENST00000495312 NUP160Q12769 1436 aa48.31■■■■■ 5.32
TMEM214-213ENST00000495312 CEP170Q5SW79 1584 aa48.27■■■■■ 5.32
TMEM214-213ENST00000495312 ERCC6L2Q5T890 1561 aa48.07■■■■■ 5.29
TMEM214-213ENST00000495312 SHROOM2Q13796 1616 aa48.03■■■■■ 5.28
TMEM214-213ENST00000495312 IGF1RP08069 1367 aa47.96■■■■■ 5.27
TMEM214-213ENST00000495312 KIF27Q86VH2 1401 aa47.96■■■■■ 5.27
TMEM214-213ENST00000495312 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa47.82■■■■■ 5.25
TMEM214-213ENST00000495312 CUL7Q14999 1698 aa47.78■■■■■ 5.24
TMEM214-213ENST00000495312 TRHP20396 242 aaPredicted RBP47.74■■■■■ 5.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms