RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574888.5

ARRB2-215, Transcript of arrestin beta 2, humanhuman

TSL 4

Gene ARRB2, Length 509 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRB2-215ENST00000574888 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.38■■■■■ 5.98
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ARRB2-215ENST00000574888 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.02■■■■■ 4.64
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ARRB2-215ENST00000574888 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.52■■■■■ 4.56
ARRB2-215ENST00000574888 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.3■■■■■ 4.52
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ARRB2-215ENST00000574888 SCRIBQ14160 1630 aa42.6■■■■■ 4.41
ARRB2-215ENST00000574888 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.4■■■■■ 4.38
ARRB2-215ENST00000574888 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.8■■■■■ 4.28
ARRB2-215ENST00000574888 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.73■■■■■ 4.27
ARRB2-215ENST00000574888 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.57■■■■■ 4.25
ARRB2-215ENST00000574888 NCAPD3P42695 1498 aa40.7■■■■■ 4.11
ARRB2-215ENST00000574888 SMARCA4P51532 1647 aa40.7■■■■■ 4.11
ARRB2-215ENST00000574888 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.65■■■■■ 4.1
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ARRB2-215ENST00000574888 SMARCA2P51531 1590 aa40.54■■■■■ 4.08
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ARRB2-215ENST00000574888 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.32■■■■■ 4.05
ARRB2-215ENST00000574888 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.27■■■■■ 4.04
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ARRB2-215ENST00000574888 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.51■■■■□ 3.92
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ARRB2-215ENST00000574888 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.03■■■■□ 3.84
ARRB2-215ENST00000574888 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.02■■■■□ 3.84
ARRB2-215ENST00000574888 CEP164Q9UPV0 1460 aa39■■■■□ 3.83
ARRB2-215ENST00000574888 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.98■■■■□ 3.83
ARRB2-215ENST00000574888 WDR62O43379 1518 aa38.91■■■■□ 3.82
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ARRB2-215ENST00000574888 WDR97A6NE52 1622 aa37.58■■■■□ 3.61
ARRB2-215ENST00000574888 FBLN2P98095 1184 aa37.5■■■■□ 3.59
ARRB2-215ENST00000574888 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.5■■■■□ 3.59
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ARRB2-215ENST00000574888 CUL7Q14999 1698 aa36.51■■■■□ 3.43
ARRB2-215ENST00000574888 JPH4Q96JJ6 628 aa36.5■■■■□ 3.43
ARRB2-215ENST00000574888 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.46■■■■□ 3.43
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