RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575877.5

ARRB2-218, Transcript of arrestin beta 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ARRB2, Length 1,579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRB2-218ENST00000575877 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.98■■■□□ 2.71
ARRB2-218ENST00000575877 ABCC9O60706 1549 aa30.08■■■□□ 2.41
ARRB2-218ENST00000575877 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.2■■■□□ 2.27
ARRB2-218ENST00000575877 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.04■■■□□ 2.24
ARRB2-218ENST00000575877 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.21■■■□□ 2.11
ARRB2-218ENST00000575877 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.78■■■□□ 2.042e-6■■■■□ 23.9
ARRB2-218ENST00000575877 NACADO15069 1562 aa27.76■■■□□ 2.03
ARRB2-218ENST00000575877 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.73■■■□□ 2.03
ARRB2-218ENST00000575877 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.48■■□□□ 1.99
ARRB2-218ENST00000575877 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.33■■□□□ 1.97
ARRB2-218ENST00000575877 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.29■■□□□ 1.96
ARRB2-218ENST00000575877 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.18■■□□□ 1.94
ARRB2-218ENST00000575877 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.17■■□□□ 1.94
ARRB2-218ENST00000575877 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.03■■□□□ 1.92
ARRB2-218ENST00000575877 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.93■■□□□ 1.9
ARRB2-218ENST00000575877 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
ARRB2-218ENST00000575877 SCRIBQ14160 1630 aa26.54■■□□□ 1.84
ARRB2-218ENST00000575877 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.34■■□□□ 1.81
ARRB2-218ENST00000575877 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
ARRB2-218ENST00000575877 CUX2O14529 1486 aa26.3■■□□□ 1.8
ARRB2-218ENST00000575877 ERCC6Q03468 1493 aa26.02■■□□□ 1.76
ARRB2-218ENST00000575877 TRIM41Q8WV44 630 aa25.76■■□□□ 1.71
ARRB2-218ENST00000575877 NCAPD3P42695 1498 aa25.6■■□□□ 1.69
ARRB2-218ENST00000575877 NESP48681 1621 aa25.58■■□□□ 1.69
ARRB2-218ENST00000575877 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
ARRB2-218ENST00000575877 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.42■■□□□ 1.66
ARRB2-218ENST00000575877 HMGXB3Q12766 1538 aa25.39■■□□□ 1.65
ARRB2-218ENST00000575877 SMARCA2P51531 1590 aa25.35■■□□□ 1.65
ARRB2-218ENST00000575877 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.31■■□□□ 1.64
ARRB2-218ENST00000575877 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.24■■□□□ 1.63
ARRB2-218ENST00000575877 SMARCA4P51532 1647 aa25.21■■□□□ 1.63
ARRB2-218ENST00000575877 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
ARRB2-218ENST00000575877 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
ARRB2-218ENST00000575877 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.05■■□□□ 1.6
ARRB2-218ENST00000575877 WDR62O43379 1518 aa24.95■■□□□ 1.59
ARRB2-218ENST00000575877 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.95■■□□□ 1.59
ARRB2-218ENST00000575877 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.94■■□□□ 1.58
ARRB2-218ENST00000575877 OSCARQ8IYS5 282 aa24.84■■□□□ 1.57
ARRB2-218ENST00000575877 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.81■■□□□ 1.56
ARRB2-218ENST00000575877 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.81■■□□□ 1.56
ARRB2-218ENST00000575877 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.81■■□□□ 1.56
ARRB2-218ENST00000575877 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.76■■□□□ 1.55
ARRB2-218ENST00000575877 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.66■■□□□ 1.54
ARRB2-218ENST00000575877 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.65■■□□□ 1.54
ARRB2-218ENST00000575877 ARHGEF11O15085 1522 aa24.58■■□□□ 1.53
ARRB2-218ENST00000575877 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.53■■□□□ 1.52
ARRB2-218ENST00000575877 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
ARRB2-218ENST00000575877 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
ARRB2-218ENST00000575877 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
ARRB2-218ENST00000575877 WIZO95785 1651 aa24.36■■□□□ 1.49
ARRB2-218ENST00000575877 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.35■■□□□ 1.49
ARRB2-218ENST00000575877 CFTRP13569 1480 aa24.3■■□□□ 1.48
ARRB2-218ENST00000575877 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
ARRB2-218ENST00000575877 ARAP1Q96P48 1450 aa24.28■■□□□ 1.48
ARRB2-218ENST00000575877 CHD1O14646 1710 aa24.2■■□□□ 1.46
ARRB2-218ENST00000575877 IFT140Q96RY7 1462 aa24.18■■□□□ 1.46
ARRB2-218ENST00000575877 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
ARRB2-218ENST00000575877 PRDM2Q13029 1718 aa24.15■■□□□ 1.46
ARRB2-218ENST00000575877 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
ARRB2-218ENST00000575877 TOPBP1Q92547 1522 aa23.97■■□□□ 1.43
ARRB2-218ENST00000575877 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
ARRB2-218ENST00000575877 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.9■■□□□ 1.422e-6■■■■■ 38
ARRB2-218ENST00000575877 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
ARRB2-218ENST00000575877 FBLN2P98095 1184 aa23.87■■□□□ 1.41
ARRB2-218ENST00000575877 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.84■■□□□ 1.41
ARRB2-218ENST00000575877 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.82■■□□□ 1.4
ARRB2-218ENST00000575877 ABCC8Q09428 1581 aa23.79■■□□□ 1.4
ARRB2-218ENST00000575877 SYNJ1O43426 1573 aa23.7■■□□□ 1.38
ARRB2-218ENST00000575877 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
ARRB2-218ENST00000575877 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.67■■□□□ 1.38
ARRB2-218ENST00000575877 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.64■■□□□ 1.37
ARRB2-218ENST00000575877 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.6■■□□□ 1.37
ARRB2-218ENST00000575877 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.6■■□□□ 1.37
ARRB2-218ENST00000575877 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
ARRB2-218ENST00000575877 WDR97A6NE52 1622 aa23.53■■□□□ 1.36
ARRB2-218ENST00000575877 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
ARRB2-218ENST00000575877 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
ARRB2-218ENST00000575877 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
ARRB2-218ENST00000575877 SOGA1O94964 1423 aa23.48■■□□□ 1.35
ARRB2-218ENST00000575877 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.47■■□□□ 1.35
ARRB2-218ENST00000575877 SYNJ2O15056 1496 aa23.46■■□□□ 1.35
ARRB2-218ENST00000575877 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.41■■□□□ 1.34
ARRB2-218ENST00000575877 GRIN2BQ13224 1484 aa23.41■■□□□ 1.34
ARRB2-218ENST00000575877 PBRM1Q86U86 1689 aa23.4■■□□□ 1.34
ARRB2-218ENST00000575877 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.39■■□□□ 1.33
ARRB2-218ENST00000575877 CEP170Q5SW79 1584 aa23.24■■□□□ 1.31
ARRB2-218ENST00000575877 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.23■■□□□ 1.31
ARRB2-218ENST00000575877 CUX1P39880 1505 aa23.23■■□□□ 1.31
ARRB2-218ENST00000575877 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.18■■□□□ 1.3
ARRB2-218ENST00000575877 SHROOM2Q13796 1616 aa23.17■■□□□ 1.3
ARRB2-218ENST00000575877 GRIN2AQ12879 1464 aa23.14■■□□□ 1.3
ARRB2-218ENST00000575877 KDM6BO15054 1643 aa23.12■■□□□ 1.29
ARRB2-218ENST00000575877 NUP160Q12769 1436 aa23.09■■□□□ 1.29
ARRB2-218ENST00000575877 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.09■■□□□ 1.29
ARRB2-218ENST00000575877 DIP2BQ9P265 1576 aa23.07■■□□□ 1.28
ARRB2-218ENST00000575877 ADAMTS12P58397 1594 aa23.07■■□□□ 1.28
ARRB2-218ENST00000575877 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.05■■□□□ 1.28
ARRB2-218ENST00000575877 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.04■■□□□ 1.28
ARRB2-218ENST00000575877 TSPOAP1O95153 1857 aa23■■□□□ 1.27
ARRB2-218ENST00000575877 MAPKBP1O60336 1514 aa23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms