Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LYVE1Q9Y5Y7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LYVE1Q9Y5Y7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms