Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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SNX13Q9Y5W8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX13Q9Y5W8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX13Q9Y5W8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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