Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
DTX4Q9Y2E6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms