Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHA12Q9UN75 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHA12Q9UN75 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHA12Q9UN75 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHA12Q9UN75 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHA12Q9UN75 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHA12Q9UN75 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHA12Q9UN75 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHA12Q9UN75 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHA12Q9UN75 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHA12Q9UN75 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHA12Q9UN75 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHA12Q9UN75 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHA12Q9UN75 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHA12Q9UN75 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHA12Q9UN75 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHA12Q9UN75 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHA12Q9UN75 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHA12Q9UN75 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHA12Q9UN75 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHA12Q9UN75 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHA12Q9UN75 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHA12Q9UN75 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHA12Q9UN75 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHA12Q9UN75 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHA12Q9UN75 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHA12Q9UN75 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHA12Q9UN75 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHA12Q9UN75 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHA12Q9UN75 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHA12Q9UN75 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHA12Q9UN75 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHA12Q9UN75 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHA12Q9UN75 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHA12Q9UN75 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHA12Q9UN75 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHA12Q9UN75 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHA12Q9UN75 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHA12Q9UN75 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHA12Q9UN75 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHA12Q9UN75 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHA12Q9UN75 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHA12Q9UN75 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms