Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY0

PRND, Prion-like protein doppel, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNDQ9UKY0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRNDQ9UKY0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRNDQ9UKY0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms