Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
TNIKQ9UKE5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
TNIKQ9UKE5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
TNIKQ9UKE5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
TNIKQ9UKE5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
TNIKQ9UKE5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
TNIKQ9UKE5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
TNIKQ9UKE5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
TNIKQ9UKE5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
TNIKQ9UKE5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
TNIKQ9UKE5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
TNIKQ9UKE5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
TNIKQ9UKE5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
TNIKQ9UKE5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
TNIKQ9UKE5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
TNIKQ9UKE5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
TNIKQ9UKE5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
TNIKQ9UKE5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
TNIKQ9UKE5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
TNIKQ9UKE5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
TNIKQ9UKE5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
TNIKQ9UKE5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
TNIKQ9UKE5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
TNIKQ9UKE5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
TNIKQ9UKE5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
TNIKQ9UKE5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
TNIKQ9UKE5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
TNIKQ9UKE5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
TNIKQ9UKE5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
TNIKQ9UKE5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
TNIKQ9UKE5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
TNIKQ9UKE5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
TNIKQ9UKE5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
TNIKQ9UKE5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
TNIKQ9UKE5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
TNIKQ9UKE5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
TNIKQ9UKE5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
TNIKQ9UKE5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
TNIKQ9UKE5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
TNIKQ9UKE5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
TNIKQ9UKE5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
TNIKQ9UKE5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
TNIKQ9UKE5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
TNIKQ9UKE5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
TNIKQ9UKE5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
TNIKQ9UKE5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
TNIKQ9UKE5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
TNIKQ9UKE5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
TNIKQ9UKE5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
TNIKQ9UKE5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
TNIKQ9UKE5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
TNIKQ9UKE5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
TNIKQ9UKE5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
TNIKQ9UKE5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
TNIKQ9UKE5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
TNIKQ9UKE5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
TNIKQ9UKE5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
TNIKQ9UKE5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
TNIKQ9UKE5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
TNIKQ9UKE5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
TNIKQ9UKE5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
TNIKQ9UKE5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
TNIKQ9UKE5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC36.82■■■■□ 3.49
TNIKQ9UKE5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
TNIKQ9UKE5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.49
TNIKQ9UKE5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
TNIKQ9UKE5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
TNIKQ9UKE5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
TNIKQ9UKE5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
TNIKQ9UKE5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
TNIKQ9UKE5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
TNIKQ9UKE5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
TNIKQ9UKE5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
TNIKQ9UKE5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
TNIKQ9UKE5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
TNIKQ9UKE5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
TNIKQ9UKE5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
TNIKQ9UKE5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
TNIKQ9UKE5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
TNIKQ9UKE5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
TNIKQ9UKE5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
TNIKQ9UKE5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
TNIKQ9UKE5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
TNIKQ9UKE5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
TNIKQ9UKE5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC36.81■■■■□ 3.48
TNIKQ9UKE5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
TNIKQ9UKE5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
TNIKQ9UKE5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
TNIKQ9UKE5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
TNIKQ9UKE5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
TNIKQ9UKE5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
TNIKQ9UKE5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
TNIKQ9UKE5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
TNIKQ9UKE5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
TNIKQ9UKE5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
TNIKQ9UKE5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
TNIKQ9UKE5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
TNIKQ9UKE5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
TNIKQ9UKE5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
TNIKQ9UKE5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 252.4 ms