Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CGGBP1Q9UFW8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CGGBP1Q9UFW8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
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