Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DKK2Q9UBU2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DKK2Q9UBU2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms