Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPG2Q9UBF2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPG2Q9UBF2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPG2Q9UBF2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms