Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1W8

SIRPG, Signal-regulatory protein gamma, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRPGQ9P1W8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIRPGQ9P1W8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIRPGQ9P1W8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIRPGQ9P1W8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIRPGQ9P1W8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIRPGQ9P1W8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIRPGQ9P1W8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIRPGQ9P1W8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIRPGQ9P1W8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIRPGQ9P1W8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIRPGQ9P1W8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRPGQ9P1W8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRPGQ9P1W8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRPGQ9P1W8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRPGQ9P1W8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRPGQ9P1W8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRPGQ9P1W8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRPGQ9P1W8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRPGQ9P1W8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRPGQ9P1W8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRPGQ9P1W8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIRPGQ9P1W8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIRPGQ9P1W8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIRPGQ9P1W8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SIRPGQ9P1W8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIRPGQ9P1W8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIRPGQ9P1W8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIRPGQ9P1W8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIRPGQ9P1W8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIRPGQ9P1W8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIRPGQ9P1W8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIRPGQ9P1W8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIRPGQ9P1W8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIRPGQ9P1W8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIRPGQ9P1W8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIRPGQ9P1W8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIRPGQ9P1W8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIRPGQ9P1W8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIRPGQ9P1W8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIRPGQ9P1W8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRPGQ9P1W8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms