Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMC4Q9NTJ3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SMC4Q9NTJ3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SMC4Q9NTJ3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMC4Q9NTJ3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMC4Q9NTJ3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMC4Q9NTJ3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMC4Q9NTJ3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMC4Q9NTJ3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SMC4Q9NTJ3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMC4Q9NTJ3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMC4Q9NTJ3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMC4Q9NTJ3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMC4Q9NTJ3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMC4Q9NTJ3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SMC4Q9NTJ3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMC4Q9NTJ3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMC4Q9NTJ3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMC4Q9NTJ3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMC4Q9NTJ3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMC4Q9NTJ3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMC4Q9NTJ3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMC4Q9NTJ3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMC4Q9NTJ3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMC4Q9NTJ3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMC4Q9NTJ3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMC4Q9NTJ3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMC4Q9NTJ3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMC4Q9NTJ3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMC4Q9NTJ3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMC4Q9NTJ3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMC4Q9NTJ3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMC4Q9NTJ3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMC4Q9NTJ3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMC4Q9NTJ3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMC4Q9NTJ3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMC4Q9NTJ3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMC4Q9NTJ3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMC4Q9NTJ3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMC4Q9NTJ3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMC4Q9NTJ3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMC4Q9NTJ3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMC4Q9NTJ3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMC4Q9NTJ3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMC4Q9NTJ3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMC4Q9NTJ3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMC4Q9NTJ3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMC4Q9NTJ3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMC4Q9NTJ3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMC4Q9NTJ3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMC4Q9NTJ3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SMC4Q9NTJ3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMC4Q9NTJ3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMC4Q9NTJ3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SMC4Q9NTJ3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMC4Q9NTJ3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMC4Q9NTJ3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMC4Q9NTJ3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMC4Q9NTJ3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMC4Q9NTJ3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMC4Q9NTJ3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMC4Q9NTJ3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMC4Q9NTJ3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMC4Q9NTJ3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMC4Q9NTJ3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SMC4Q9NTJ3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMC4Q9NTJ3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMC4Q9NTJ3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SMC4Q9NTJ3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMC4Q9NTJ3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMC4Q9NTJ3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMC4Q9NTJ3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMC4Q9NTJ3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SMC4Q9NTJ3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMC4Q9NTJ3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMC4Q9NTJ3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMC4Q9NTJ3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMC4Q9NTJ3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms