Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PNPLA3Q9NST1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNPLA3Q9NST1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms