Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BATF3Q9NR55 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BATF3Q9NR55 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BATF3Q9NR55 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms