Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BPIFA1Q9NP55 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
BPIFA1Q9NP55 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms