Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC3Q9BY71 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC3Q9BY71 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms