Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
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SAMD8Q96LT4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAMD8Q96LT4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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SAMD8Q96LT4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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SAMD8Q96LT4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAMD8Q96LT4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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