Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
UBE2E2Q96LR5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE2E2Q96LR5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms