Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SRSF12Q8WXF0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF12Q8WXF0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF12Q8WXF0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF12Q8WXF0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF12Q8WXF0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF12Q8WXF0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF12Q8WXF0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF12Q8WXF0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF12Q8WXF0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF12Q8WXF0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF12Q8WXF0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF12Q8WXF0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF12Q8WXF0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF12Q8WXF0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SRSF12Q8WXF0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF12Q8WXF0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF12Q8WXF0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF12Q8WXF0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF12Q8WXF0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF12Q8WXF0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF12Q8WXF0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF12Q8WXF0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF12Q8WXF0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF12Q8WXF0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF12Q8WXF0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF12Q8WXF0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF12Q8WXF0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF12Q8WXF0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF12Q8WXF0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF12Q8WXF0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF12Q8WXF0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF12Q8WXF0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF12Q8WXF0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF12Q8WXF0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF12Q8WXF0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF12Q8WXF0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF12Q8WXF0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF12Q8WXF0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF12Q8WXF0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF12Q8WXF0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms