Protein–RNA interactions for Protein: Q8TA86

RP9, Retinitis pigmentosa 9 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP9Q8TA86 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RP9Q8TA86 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RP9Q8TA86 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RP9Q8TA86 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RP9Q8TA86 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RP9Q8TA86 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RP9Q8TA86 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms