Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I0

SYT2, Synaptotagmin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT2Q8N9I0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYT2Q8N9I0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYT2Q8N9I0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYT2Q8N9I0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYT2Q8N9I0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYT2Q8N9I0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYT2Q8N9I0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYT2Q8N9I0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYT2Q8N9I0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYT2Q8N9I0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYT2Q8N9I0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYT2Q8N9I0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYT2Q8N9I0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYT2Q8N9I0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYT2Q8N9I0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYT2Q8N9I0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYT2Q8N9I0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYT2Q8N9I0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SYT2Q8N9I0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYT2Q8N9I0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYT2Q8N9I0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYT2Q8N9I0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYT2Q8N9I0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SYT2Q8N9I0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYT2Q8N9I0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYT2Q8N9I0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYT2Q8N9I0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYT2Q8N9I0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYT2Q8N9I0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYT2Q8N9I0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SYT2Q8N9I0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms