Protein–RNA interactions for Protein: Q86U37

LINC01551, Uncharacterized protein encoded by LINC01551, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01551Q86U37 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01551Q86U37 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01551Q86U37 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01551Q86U37 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01551Q86U37 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01551Q86U37 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
LINC01551Q86U37 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01551Q86U37 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01551Q86U37 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01551Q86U37 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01551Q86U37 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01551Q86U37 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01551Q86U37 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01551Q86U37 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01551Q86U37 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01551Q86U37 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01551Q86U37 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01551Q86U37 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01551Q86U37 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms