Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFXL1Q6ZNB6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NFXL1Q6ZNB6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms