Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.5 ms