Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSSK4Q6SA08 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSSK4Q6SA08 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms