Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ2

PHLDB3, Pleckstrin homology-like domain family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDB3Q6NSJ2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PHLDB3Q6NSJ2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms