Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6S3

PHF19, PHD finger protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF19Q5T6S3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF19Q5T6S3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF19Q5T6S3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF19Q5T6S3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF19Q5T6S3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF19Q5T6S3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF19Q5T6S3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF19Q5T6S3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF19Q5T6S3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF19Q5T6S3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF19Q5T6S3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF19Q5T6S3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF19Q5T6S3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF19Q5T6S3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF19Q5T6S3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF19Q5T6S3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF19Q5T6S3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF19Q5T6S3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF19Q5T6S3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF19Q5T6S3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF19Q5T6S3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF19Q5T6S3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF19Q5T6S3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF19Q5T6S3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF19Q5T6S3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF19Q5T6S3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF19Q5T6S3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF19Q5T6S3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF19Q5T6S3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF19Q5T6S3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms