Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D3

OTUD3, OTU domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD3Q5T2D3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
OTUD3Q5T2D3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTUD3Q5T2D3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
OTUD3Q5T2D3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTUD3Q5T2D3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTUD3Q5T2D3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTUD3Q5T2D3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTUD3Q5T2D3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTUD3Q5T2D3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTUD3Q5T2D3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTUD3Q5T2D3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTUD3Q5T2D3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTUD3Q5T2D3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTUD3Q5T2D3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTUD3Q5T2D3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTUD3Q5T2D3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTUD3Q5T2D3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTUD3Q5T2D3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTUD3Q5T2D3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTUD3Q5T2D3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTUD3Q5T2D3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTUD3Q5T2D3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTUD3Q5T2D3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTUD3Q5T2D3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms