Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CC2D1BQ5T0F9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CC2D1BQ5T0F9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CC2D1BQ5T0F9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CC2D1BQ5T0F9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CC2D1BQ5T0F9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CC2D1BQ5T0F9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CC2D1BQ5T0F9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CC2D1BQ5T0F9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CC2D1BQ5T0F9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CC2D1BQ5T0F9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CC2D1BQ5T0F9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CC2D1BQ5T0F9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CC2D1BQ5T0F9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
CC2D1BQ5T0F9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CC2D1BQ5T0F9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
CC2D1BQ5T0F9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CC2D1BQ5T0F9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CC2D1BQ5T0F9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CC2D1BQ5T0F9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CC2D1BQ5T0F9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CC2D1BQ5T0F9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CC2D1BQ5T0F9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CC2D1BQ5T0F9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CC2D1BQ5T0F9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CC2D1BQ5T0F9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CC2D1BQ5T0F9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CC2D1BQ5T0F9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CC2D1BQ5T0F9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CC2D1BQ5T0F9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
CC2D1BQ5T0F9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
CC2D1BQ5T0F9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
CC2D1BQ5T0F9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CC2D1BQ5T0F9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CC2D1BQ5T0F9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CC2D1BQ5T0F9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CC2D1BQ5T0F9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CC2D1BQ5T0F9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CC2D1BQ5T0F9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CC2D1BQ5T0F9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CC2D1BQ5T0F9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CC2D1BQ5T0F9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CC2D1BQ5T0F9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CC2D1BQ5T0F9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
CC2D1BQ5T0F9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CC2D1BQ5T0F9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CC2D1BQ5T0F9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CC2D1BQ5T0F9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CC2D1BQ5T0F9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CC2D1BQ5T0F9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CC2D1BQ5T0F9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CC2D1BQ5T0F9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CC2D1BQ5T0F9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CC2D1BQ5T0F9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CC2D1BQ5T0F9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CC2D1BQ5T0F9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CC2D1BQ5T0F9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CC2D1BQ5T0F9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CC2D1BQ5T0F9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CC2D1BQ5T0F9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CC2D1BQ5T0F9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CC2D1BQ5T0F9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CC2D1BQ5T0F9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CC2D1BQ5T0F9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CC2D1BQ5T0F9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CC2D1BQ5T0F9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CC2D1BQ5T0F9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CC2D1BQ5T0F9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CC2D1BQ5T0F9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CC2D1BQ5T0F9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms