Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZM63

ETDB, Embryonic testis differentiation homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETDBQ3ZM63 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ETDBQ3ZM63 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ETDBQ3ZM63 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ETDBQ3ZM63 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ETDBQ3ZM63 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ETDBQ3ZM63 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ETDBQ3ZM63 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ETDBQ3ZM63 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ETDBQ3ZM63 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ETDBQ3ZM63 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETDBQ3ZM63 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ETDBQ3ZM63 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ETDBQ3ZM63 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ETDBQ3ZM63 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETDBQ3ZM63 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ETDBQ3ZM63 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETDBQ3ZM63 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ETDBQ3ZM63 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETDBQ3ZM63 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETDBQ3ZM63 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETDBQ3ZM63 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ETDBQ3ZM63 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETDBQ3ZM63 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETDBQ3ZM63 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ETDBQ3ZM63 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETDBQ3ZM63 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETDBQ3ZM63 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETDBQ3ZM63 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETDBQ3ZM63 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ETDBQ3ZM63 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETDBQ3ZM63 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETDBQ3ZM63 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ETDBQ3ZM63 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETDBQ3ZM63 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETDBQ3ZM63 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETDBQ3ZM63 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ETDBQ3ZM63 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ETDBQ3ZM63 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ETDBQ3ZM63 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ETDBQ3ZM63 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ETDBQ3ZM63 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ETDBQ3ZM63 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETDBQ3ZM63 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ETDBQ3ZM63 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ETDBQ3ZM63 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ETDBQ3ZM63 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETDBQ3ZM63 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ETDBQ3ZM63 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETDBQ3ZM63 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETDBQ3ZM63 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETDBQ3ZM63 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ETDBQ3ZM63 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ETDBQ3ZM63 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETDBQ3ZM63 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETDBQ3ZM63 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETDBQ3ZM63 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETDBQ3ZM63 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETDBQ3ZM63 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETDBQ3ZM63 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETDBQ3ZM63 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ETDBQ3ZM63 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ETDBQ3ZM63 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ETDBQ3ZM63 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETDBQ3ZM63 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ETDBQ3ZM63 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ETDBQ3ZM63 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ETDBQ3ZM63 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETDBQ3ZM63 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ETDBQ3ZM63 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ETDBQ3ZM63 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ETDBQ3ZM63 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ETDBQ3ZM63 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ETDBQ3ZM63 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ETDBQ3ZM63 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ETDBQ3ZM63 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ETDBQ3ZM63 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ETDBQ3ZM63 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ETDBQ3ZM63 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ETDBQ3ZM63 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ETDBQ3ZM63 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ETDBQ3ZM63 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ETDBQ3ZM63 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ETDBQ3ZM63 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ETDBQ3ZM63 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ETDBQ3ZM63 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ETDBQ3ZM63 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ETDBQ3ZM63 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ETDBQ3ZM63 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ETDBQ3ZM63 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms