Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
COL24A1Q17RW2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
COL24A1Q17RW2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
COL24A1Q17RW2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
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