Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKN3Q16667 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDKN3Q16667 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms