Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
EXT1Q16394 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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EXT1Q16394 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EXT1Q16394 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
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