Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSX2Q16385 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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