Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEDD8Q15843 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD8Q15843 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD8Q15843 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD8Q15843 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD8Q15843 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD8Q15843 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD8Q15843 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD8Q15843 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD8Q15843 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD8Q15843 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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