Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.241e-7■■■■■ 44.9
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PCBP2Q15366 INO80-205ENST00000558357 5503 ntTSL 1 (best)10.98□□□□□ -0.651e-7■■■■■ 44.9
PCBP2Q15366 NR1D1-201ENST00000246672 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.482e-8■■■■■ 44.9
PCBP2Q15366 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.225e-10■■■■■ 44.9
PCBP2Q15366 SPECC1L-201ENST00000314328 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.635e-10■■■■■ 44.9
PCBP2Q15366 SPECC1L-204ENST00000437398 6674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.655e-10■■■■■ 44.9
PCBP2Q15366 SPECC1L-207ENST00000541492 3525 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.365e-10■■■■■ 44.9
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PCBP2Q15366 CD74-203ENST00000377795 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.361e-48■■■■■ 44.9
PCBP2Q15366 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.431e-48■■■■■ 44.9
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PCBP2Q15366 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.267e-8■■■■■ 44.8
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PCBP2Q15366 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.037e-8■■■■■ 44.8
PCBP2Q15366 MED16-210ENST00000606248 3181 ntTSL 1 (best)13.61□□□□□ -0.237e-8■■■■■ 44.8
PCBP2Q15366 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.297e-8■■■■■ 44.8
PCBP2Q15366 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.367e-8■■■■■ 44.8
PCBP2Q15366 FUT8-207ENST00000554610 554 ntTSL 418.56■□□□□ 0.566e-7■■■■■ 44.8
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PCBP2Q15366 FUT8-201ENST00000342677 2490 ntTSL 1 (best)13.81□□□□□ -0.26e-7■■■■■ 44.8
PCBP2Q15366 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.36e-7■■■■■ 44.8
PCBP2Q15366 FUT8-212ENST00000556518 639 ntTSL 212.87□□□□□ -0.356e-7■■■■■ 44.8
PCBP2Q15366 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.376e-7■■■■■ 44.8
PCBP2Q15366 FUT8-204ENST00000394586 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.626e-7■■■■■ 44.8
PCBP2Q15366 FUT8-210ENST00000555559 583 ntTSL 44.04□□□□□ -1.766e-7■■■■■ 44.8
PCBP2Q15366 PHF14-208ENST00000481418 792 ntTSL 37.18□□□□□ -1.265e-7■■■■■ 44.8
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PCBP2Q15366 DCUN1D4-222ENST00000513800 949 ntTSL 223.56■■□□□ 1.367e-9■■■■■ 44.8
PCBP2Q15366 DCUN1D4-211ENST00000506673 548 ntTSL 423.56■■□□□ 1.367e-9■■■■■ 44.8
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PCBP2Q15366 DCUN1D4-205ENST00000502930 548 ntTSL 422.75■■□□□ 1.237e-9■■■■■ 44.8
PCBP2Q15366 DCUN1D4-206ENST00000504113 594 ntTSL 421.3■■□□□ 17e-9■■■■■ 44.8
PCBP2Q15366 DCUN1D4-209ENST00000505403 645 ntTSL 420.87■□□□□ 0.937e-9■■■■■ 44.8
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PCBP2Q15366 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.157e-9■■■■■ 44.8
PCBP2Q15366 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.247e-9■■■■■ 44.8
PCBP2Q15366 DCUN1D4-204ENST00000477560 4840 ntTSL 24.46□□□□□ -1.77e-9■■■■■ 44.8
PCBP2Q15366 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.298e-10■■■■■ 44.8
PCBP2Q15366 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.158e-10■■■■■ 44.8
PCBP2Q15366 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.038e-10■■■■■ 44.8
PCBP2Q15366 GSKIP-203ENST00000554182 760 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.468e-10■■■■■ 44.8
PCBP2Q15366 GSKIP-204ENST00000555088 648 ntTSL 512.15□□□□□ -0.468e-10■■■■■ 44.8
PCBP2Q15366 GSKIP-202ENST00000553699 501 ntTSL 48.95□□□□□ -0.988e-10■■■■■ 44.8
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PCBP2Q15366 MREG-204ENST00000439791 576 ntTSL 45.28□□□□□ -1.567e-9■■■■■ 44.7
PCBP2Q15366 KDM4C-205ENST00000428870 3039 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.244e-9■■■■■ 44.7
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PCBP2Q15366 SERPINA3-202ENST00000393080 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.582e-7■■■■■ 44.6
PCBP2Q15366 SERPINA3-208ENST00000556968 1289 ntTSL 1 (best)10.28□□□□□ -0.762e-7■■■■■ 44.6
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PCBP2Q15366 CHID1-213ENST00000528521 323 ntTSL 59.18□□□□□ -0.944e-7■■■■■ 44.6
PCBP2Q15366 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.023e-7■■■■■ 44.6
PCBP2Q15366 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.279e-11■■■■■ 44.6
PCBP2Q15366 PDIA5-205ENST00000484644 667 ntTSL 522.83■■□□□ 1.259e-11■■■■■ 44.6
PCBP2Q15366 AC037459.1-201ENST00000450780 977 ntTSL 521.78■■□□□ 1.089e-11■■■■■ 44.6
PCBP2Q15366 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.69e-11■■■■■ 44.6
PCBP2Q15366 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.419e-11■■■■■ 44.6
PCBP2Q15366 AC037459.1-203ENST00000447849 794 ntTSL 516.35■□□□□ 0.219e-11■■■■■ 44.6
PCBP2Q15366 ZNF707-212ENST00000527561 1252 ntTSL 215.06■□□□□ 09e-11■■■■■ 44.6
PCBP2Q15366 LMF1-209ENST00000566627 694 ntTSL 314.71□□□□□ -0.059e-11■■■■■ 44.6
PCBP2Q15366 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.329e-11■■■■■ 44.6
PCBP2Q15366 PLEKHG2-201ENST00000205135 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)12.64□□□□□ -0.399e-11■■■■■ 44.6
PCBP2Q15366 ATP9B-203ENST00000458297 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.659e-11■■■■■ 44.6
PCBP2Q15366 ATP9B-201ENST00000307671 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.739e-11■■■■■ 44.6
PCBP2Q15366 ATP9B-204ENST00000490210 7353 ntTSL 1 (best)9.84□□□□□ -0.839e-11■■■■■ 44.6
PCBP2Q15366 PDIA5-208ENST00000495004 563 ntTSL 39.78□□□□□ -0.849e-11■■■■■ 44.6
PCBP2Q15366 YWHAE-209ENST00000572108 258 ntTSL 39.21□□□□□ -0.949e-11■■■■■ 44.6
PCBP2Q15366 ATP9B-202ENST00000426216 4361 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.029e-11■■■■■ 44.6
PCBP2Q15366 ATP9B-206ENST00000586366 2845 ntTSL 27.04□□□□□ -1.289e-11■■■■■ 44.6
PCBP2Q15366 ATP9B-221ENST00000590271 1923 ntTSL 26.91□□□□□ -1.39e-11■■■■■ 44.6
PCBP2Q15366 RNF103-CHMP3-201ENST00000440757 805 ntTSL 317.31■□□□□ 0.366e-7■■■■■ 44.5
PCBP2Q15366 CHMP3-207ENST00000485465 920 ntTSL 317■□□□□ 0.316e-7■■■■■ 44.5
PCBP2Q15366 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.066e-7■■■■■ 44.5
PCBP2Q15366 CHMP3-202ENST00000393773 727 ntTSL 314.06□□□□□ -0.166e-7■■■■■ 44.5
PCBP2Q15366 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.336e-7■■■■■ 44.5
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