Protein–RNA interactions for Protein: Q08AE8

SPIRE1, Protein spire homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1Q08AE8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPIRE1Q08AE8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPIRE1Q08AE8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SPIRE1Q08AE8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPIRE1Q08AE8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPIRE1Q08AE8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPIRE1Q08AE8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPIRE1Q08AE8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SPIRE1Q08AE8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPIRE1Q08AE8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPIRE1Q08AE8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPIRE1Q08AE8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPIRE1Q08AE8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPIRE1Q08AE8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPIRE1Q08AE8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPIRE1Q08AE8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPIRE1Q08AE8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPIRE1Q08AE8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPIRE1Q08AE8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SPIRE1Q08AE8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPIRE1Q08AE8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPIRE1Q08AE8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPIRE1Q08AE8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPIRE1Q08AE8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPIRE1Q08AE8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPIRE1Q08AE8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPIRE1Q08AE8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPIRE1Q08AE8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPIRE1Q08AE8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPIRE1Q08AE8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPIRE1Q08AE8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPIRE1Q08AE8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPIRE1Q08AE8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPIRE1Q08AE8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPIRE1Q08AE8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPIRE1Q08AE8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPIRE1Q08AE8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPIRE1Q08AE8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SPIRE1Q08AE8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPIRE1Q08AE8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPIRE1Q08AE8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPIRE1Q08AE8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPIRE1Q08AE8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPIRE1Q08AE8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPIRE1Q08AE8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPIRE1Q08AE8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPIRE1Q08AE8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPIRE1Q08AE8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SPIRE1Q08AE8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPIRE1Q08AE8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPIRE1Q08AE8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPIRE1Q08AE8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms