Protein–RNA interactions for Protein: Q01973

ROR1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, humanhuman

Predictions only

Length 937 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROR1Q01973 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ROR1Q01973 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ROR1Q01973 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ROR1Q01973 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ROR1Q01973 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ROR1Q01973 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ROR1Q01973 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ROR1Q01973 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ROR1Q01973 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ROR1Q01973 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ROR1Q01973 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ROR1Q01973 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ROR1Q01973 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ROR1Q01973 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ROR1Q01973 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ROR1Q01973 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ROR1Q01973 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ROR1Q01973 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ROR1Q01973 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ROR1Q01973 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ROR1Q01973 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ROR1Q01973 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ROR1Q01973 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ROR1Q01973 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ROR1Q01973 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ROR1Q01973 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ROR1Q01973 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ROR1Q01973 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ROR1Q01973 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ROR1Q01973 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms